皮膚の一部を取って顕微鏡で白癬菌がいることを確認します。

頭皮の水虫は直接検鏡法では菌がみつからない場合があるので、菌を培地で増やして（培養）確認します。
一見水虫のようにみえても、汗疱・接触皮膚炎・掌蹠膿疱症など水虫とは異なる病気の場合もあるので、自己判断はせずご相談いただくことをおすすめします。

足・体などの皮膚の水虫には白癬菌の増殖をおさえる塗り薬（抗真菌外用剤）で治療します。
表面がきれいになっても白癬菌は角質の奥のほうに潜んでいることが多いので、見た目がきれいになってからも1〜2か月（角質がターンオーバーしてうまれかわるまで）はお薬をぬりつづけてしっかりと治しましょう。

爪や頭皮などの、塗り薬のみでは治りにくい水虫には飲み薬が効果的です。
飲み薬は副作用で肝機能障害が出ることがあるので、定期的に血液検査で肝機能を確認しながら、3か月から半年間内服します。